โยโรสุ บาคุ ชายหนุ่มธรรมดาคนหนึ่ง ที่มองว่าชีวิตของตนน่าเบื่อ เขาใช้ชีวิตอย่างเรื่อยเปื่อยให้ผ่านไปวัน ๆ จนวันหนึ่งเมื่อเขาหลับไป บาคุพบว่าตัวเขาได้ปรากฎในความฝันเป็นสายลับมือพระกาฬ ฝีมือเก่งกาจชนิดไม่มีใครเทียบได้ นอกจากนี้เขายังค้นพบพลังในการควบคุมความฝันของตนเองได้ และในความฝันเขามีบทบาทสำคัญในการช่วยเหลือ เนมุ หญิงสาวผู้ถูกกักขังโดยกลุ่มผู้ก่อการร้าย ทว่าอยู่ ๆ ในโลกความฝัน เหล่าปิศาจที่เรียกว่า ไนท์แมร์ ก็ปรากฎตัวขึ้น และพยายามที่จะทำให้ฝันร้ายกลายเป็นเรื่องจริง ตอนนั้นเองบาคุก็ได้เข็มขัดปริศนาเส้นหนึ่งจากชายลึกลับในความฝัน ดังนั้นเขาจึงใช้มันแปลงร่างเป็น มาสค์ไรเดอร์เซทซ์ เข้าหยุดยั้งการรุกรานของเหล่าไนท์แมร์ นับแต่วันนั้น ภาระกิจอันมีชะตากรรมของโลกเป็นเดิมพัน ก็ถูกส่งมอบให้กับบาคุ ปฏิบัติการพิทักษ์โลกความฝันของมาสค์ไรเดอร์เซทซ์จึงได้เริ่มต้นขึ้น